En 1207, Saint-Aubin appartenait à l’abbaye de Saint-Wandrille. C’est un fief indépendant à partir de 1662, dépendant auparavant de la baronnie de Ferrières. Le château appartint au XVIIe siècle au marquis de Pomponne, ministre de Louis XIV, puis, au XVIIIe siècle aux Choiseul-Gouffier..
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