La présence antique est affirmée par la découverte d'une tombe au hameau de Rossy.
Le village de Choisy fait partie de la province historique du Genevois des Etats de Savoie, et plus précisément de la seigneurie de Vulpillières (ou de la Vulpillière), dont le château est situé à Avregny (2,5 km au nord-est de Choisy), entre la rivière des Usses et le ruisseau de Mounant. Il s'agit un château à motte de Templiers à donjon carré datant du XIe siècle environ...
(source wikipedia)