La plus ancienne mention connue remonte en 968 ou l'on trouve marcilliaco villa sur le cartulaire d'Ainay.

Les différents noms retrouvés sont Marcilliacum, le domaine de Marcellus, puis au XIIIe siècle Marcilleu, en 1438 Marcilliaco d'Asergues, et enfin en 1573 Marcilly d'Azargues.

L'histoire de MARCILLY est marquée par 2 grandes seigneuries, avant 1718, les abbés d'Ainay et de 1718 à la révolution les Riverieulx de Varax...

(image et extrait du site officiel de la commune)