La voie romaine reliant autrefois Epomanduodurum (Mandeure,département du Doubs) à Augusta Raurica (Augst) (Suisse) et Kembs (Haut-Rhin) traversait le territoire de Lepuix. Le nom du village est mentionné pour la première fois en 1189 sous la forme Albapoys, plus tard sous le nom de Sood. Une chapelle existait déjà en 1359 mais le village dépendait de la paroisse de Courtelevant...
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