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Le lieu a été habité depuis plusieurs millénaires (traces de vie dans la grotte des Planches).
En 1788, Louis XVI autorise la création d'une paroisse aux Planches-près-Arbois, car, selon la requête des habitants, il était difficile de recevoir les derniers sacrements par mauvais temps, le prêtre le plus proche étant celui de la Châtelaine, village situé en haut de la reculée, soit 250 mètres de dénivelé.