L'origine du nom est hypothétique : Pogua (1287), Pouget (1355) ou Pogues (1370). Le site de Pougues est occupé depuis très longtemps. Une nécropole de l'âge du bronze a été découverte vers 1870.

Jusqu'au xie siècle, la ville possède peu d'importance. La paroisse est créée en 1061 par Hugues II, évêque de Nevers...

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